相比其他专业，秘书专业毕业论文还存在选题范围较窄、理论性不强等问题。在当前对本科专业是否需要撰写毕业论文尚有争议的情况下，对专科层次的秘书专业是否有必要进行毕业论文的写作在认识上和实际操作中更是存在分歧。有些学校完全取消这一环节，从规范教学管理、提高办学层次的目的出发，一些保留了专科层次毕业论文写作环节的学校，在毕业论文写作和答辩中也存在走过场的现象。由于秘书专业本身尚不成熟，学生在写作毕业论文时理论储备不足，论文雷同甚至抄袭的现象较多，秘书专业的毕业论文写作环节成为秘书专业培养过程中需要突破的瓶颈。
笔者认为，作为对所学知识和理论进行梳理、整合，将在校期间所学综合运用的一次实践性练兵，毕业论文撰写环节是必不可少的，且针对秘书这一对学生的写作素质和能力均有较高要求的`专业，毕业论文写作更是其学业训练、职业能力培养的一个重要组成部分。笔者所在学校已有二十余年的开设秘书专业的历史，对毕业论文的环节要求严格，近几年在毕业论文的指导中越来越突出的感觉到秘书专业毕业论文的指导需改进，尤其在三个方面要严格把关。
按论题的性质不同进行分类，毕业论文的论题可分为：真题真做，真题假作和假题真做三种类型。真题真做是指以来自实践第一线的尚待解决的实际问题作为毕业论文的选题，运用所学理论真刀实枪的演练，力求找到解决实际问题的方法。真题假作是指论文选题来源于实际，但做论文时可只在理论上加以解决，或者来源于实践的论题已部分得到解决，学生运用所学理论和知识模拟解决实际问题，或可得出一个全新的结论。假题真做是指虚拟的题目，学生要对这一虚拟问题进行实际的演练，运用所学理论进行分析、论证，以求找到解决方法和途径。
近年来由于扩招和就业压力所致，不同层次不同专业学生的毕业论文质量均有下降，秘书专业也不例外。
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