3.专业建设困境
(1)专业设置同质化，缺乏科学论证和有效规范。专业设置雷同，既体现在独立学院复制母校专业，在培养规格和方式上严重趋同;又体现在地区独立学院之间专业布点雷同现象严重且数量过多，一级学科多集中在经、管、文、法和信息管理类，一些热门专业如市场营销在学院重复设置率高达70%。
(2)忽视专业建设的持续性维持和有效开发。许多独立学院在专业设置时仅仅从经济利益角度出发，选择那些投资少、运行成本低、回报率高的专业，学院学科与专业不免结构混乱无序，欠缺整体规划。这严重影响到人才的培养和学院的整体发展。
(3)专业设置与区域经济需求失衡。目前，独立学院在专业设置上未能与当地经济发展有效契合，在专业设置中缺乏必要的市场调研，市场需求预测没有可靠的依据做支撑;从专业的提出到专业培养目标的设立再到教学计划的制定，基本上依托母校的资源和优势专业，并未依据市场需求和独立学院的人才培养目标去有的放矢地研究专业设置，专业教学计划存在着严重的先天不足。某些热门专业大量扩招，完全没有考虑当地经济对人才需求的容纳度，从而人为地拉大供需矛盾，造成毕业生结构性失业，呈现出专业设置与区域经济需求失衡的状态。
4.财务管理困境
(1)产权界定不清晰。独立学院的产权是在国家教育权的指导下，学校为履行教育职能而形成的一种财产权利关系，学校的产权包括对教育财产的所有权、占有权、支配权、使用权以及收益索取权等一系列权利。我国独立学院特点之一就是存在多元主体，至少包括母体高校和独立学院在内的两个以上的产权主体，各个主体利用各自的优势资源合作办学，相互监督和约束，并按照合约和其资源投入比例分配收益。但是目前独立学院在合作者与母体高校间存在一定的利益分配纠纷，未能理顺财务关系，其中最大的障碍是无法对母校无形资产进行有效且合理的评估。母体高校作为举办者，一般以品牌、师资和管理等无形资产参与独立学院办学，相较于合作方资金和实物的投入，这些无形资产的投入很难以金额精确计量，无形资产无法有效评估就无法明确区分独立学院与母校的地位和性质，相应的权责利也不明晰。不难发现，在利益分配中许多母体高校占有绝对优势，所得收益多半都上交母校用于补贴其财政支出，合作方再拿走部分盈余，这样用来留存给独立学院继续发展的结余资金少之又少，更加加剧了矛盾纠纷。
(2)财务制度不完善。由于独立学院是一种新型的办学模式，起步晚，没有合适的经验、制度可直接借鉴，所以当前独立学院的财务管理制度出现了既不健全又不和合理的一面。一方面，财务管理制度不健全，财务管理缺乏必要的制度依据，未能建立起一系列独立的预算制度、会计制度和审计制度。在预算上，许多固定资产购置随意性大、利用率低，损坏严重又不按照国家规定进行折旧。与此同时，许多办学活动都因为会计和审计制度的缺失而缺乏有效监督和制约。另一方面，当前独立学院的财务管理制度不合理。完全采用母校的财务管理制度会出现与实际财务管理状况不相符的现象，独立学院作为民营机制的办学主体与公办高校的办学特点和目的有所不同，沿用母校的.财务制度进行收入、成本、费用的核算无法与实际相匹配，甚至会产生冲突和矛盾。再者，目前大部分独立学院不注重成本核算，低成本管理较弱，成本核算不准确现象屡有发生。
(3)财务风险过大。依据我国有关法律的规定，独立学院没有国家财政投入，是自主经营、自负盈亏的高等教育机构。因此，其校园建设和其他财政支出完全要由合作方自行筹措。在缺少财政支持的情况下，银行贷款成为了筹措资金的主要渠道，而利用银行借款所带来的风险问题尚未引起足够的重视，有些独立学院不考虑实际情况一味地追求贷款额度忽视偿债能力，势必增加独立学院的办学风险。此外，当前独立学院的资金来源重心依附在学费上，一旦生源减少，其财政就会面临财政危机，当生源数量出现偏差就会减弱抵押偿还能力，进而影响其正常运行。所以，单一的资金来源加上高额的负债使独立学院财政如履薄冰，承担着巨大的办学风险和内部财务危机。 二、独立学院内部管理困境成因分析
1.管理体制上过于依附母体，欠缺独立性独立学院之所以能在短时间内发展壮大，与其对母体高校的依存是紧密相关的，它依托母体高校积淀已久的声誉以及师资、管理、文化等无形资产而迅速崛起。正是这种割舍不断的依附关系使得独立学院的成长福祸相依。尽管独立学院起步是依靠母校而快速形成规模，但是过度依赖母体就会丧失自主权。管理体制中董事会的虚设、错位、越位等造成当前独立学院仍然是依附母体高校的管理，独立学院始终被当作母校的下属学院，其合法利益时常被母校窃取，甚至成为母校发展的牺牲品。缺乏独立性的独立学院不得不承担大部分办学风险，获取小部分利益，仅有极小或是没有自主管理权力。从目前发展来看，独立学院在管理体制上独立性的丧失是造成其在内部管理中出现诸多困境的根源。
2.管理目标上过分注重短期收益忽视长期发展
高等教育属于准公共产品，具有一定的公益性特征，这是保证高等教育质量的内在特性。而以民办机制为办学特征的独立学院的合作者根本目的在于盈利，这也是资本所有者参与高校办学的动机所在，资本追利性和教育的公益性之间就产生了一定的悖论。当前，一些独立学院的管理目标将逐利奉为办学主旨，忽略教育教学质量，办学重心始终放在如何盈利而非人才培养质量的提升。从专业设置上来看，诸多专业名称虽然暂时吸引了生源，学校却没有足够的师资能力来开展教学，更难以集中力量提升专业的质量，滥竽充数的专业不在少数;从生源选拔上来看，扩招在一定范围内能够加快学校发展，但盲目降低招生标准而扩大学院规模会拉低学校的品牌水准，不能确保数量与质量的均衡发展;从师资设施上看，在硬件设施与师资建设的投入上严重不足，不能及时对校园设施、教学实验设备进行扩充和修缮。由此可见，多数独立学院在处理财与才、规模与效益的关系上显然没有找到平衡点。【独立学院内部管理困境及其破解分析研究论文】相关文章：
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